简介：1999年，日本陆上自卫队的机械人小队在一次联合国维和行动中遭到全歼。数年后，横浜大桥突然被战役机炸毁，官方报道称肇事飞机属于自卫队。民众普遍对自卫队发生了不信赖感。 特车二课第二小队的后藤队长察觉此事与在99年的那场事务中失落的自卫队队员柘植有关。而柘植是特车二课第一小队队长南云原来的情人。民众的不信赖感达到了顶峰，处于戒严状态的东京面临着大骚乱，人们被行将爆发战争的危急笼罩着。在自卫队王牌队员荒川的赞助下，后藤和南云追查到了柘植的着落。 后藤召集起泉，篠原等特车二课原来的成员们，启动PATLABOR机械人进攻柘植的根据地……
